Samtidigt som användningen av läkmedel är livsnödvändig för att förbättra människors hälsa börjar man i allt större utsträckning se aktiva läkemedelsubstanser som en potentiellt stor miljörisk. En stor mängd av de läkemedelssubstanser som används i samhället idag hamnar till slut i de akvatiska ekosystemen. En av MistraPharmas målsättningar är att identifiera vilka av de läkemedelssubstanser som används idag som utgör en betydande risk för våra vattenmiljöer. För att nå dit vill man kombinera befintlig kunskap med nya data kring exponering och effekter som genereras i programmet. MistraPharma ska också ta fram faktaunderlag som kan ligga till grund för nya rekommendationer för hur miljöriskerna med läkemedel kan hanteras. Ett exempel på detta är förslag på nya metoder för att kunna upptäcka substanser med särskilt hög miljörisk tidigt i utvecklingsprocessen av nya läkemedel. I programmet ingår även att utforma basen för nya rekommendationer och tekniker för förbättrad hantering av läkemedel i avloppsvatten.Arbetet är indelat i fyra olika arbetsområden som alla fokuserar på olika frågeställningar kring området läkemedel och miljö. För att säkerhetsställa kommunikationen och kontakterna mellan programmets svenska och internationella forskare och slutanvändarna finns det även ett kommunikationsprojekt knutet till programmet..
